Ученый совет ФГБУ «ФНЦТИО им. ак. В.И. Шумакова» Минздравсоцразвития России является высшим независимым коллегиальным органом управления, осуществляющим оценку уровня и значимости деятельности Центра.

В функции Ученого совета входят: обсуждение и утверждение планов Научного центра по научно-исследовательской и издательской деятельности, проблемных и тематических планов и отчетов подразделений; утверждение планирования и апробации диссертационных работ; утверждение решений конкурсных комиссий по вопросам замещения вакантных должностей руководителей структурных подразделений Центра, старших и младших научных сотрудников; обсуждение и представление кандидатов на научные звания.

Председателем Ученого совета является директор ФГБУ «ФНЦТИО им. ак. В.И. Шумакова» Минздравсоцразвития России, академик РАМН, доктор медицинских наук, профессор Сергей Владимирович  Готье.

Готье Сергей Владимирович – председатель, академик РАМН, д.м.н., профессор

Шумаков Дмитрий Валерьевич - зам. председателя, член-корр. РАМН, д.м.н., профессор

Шевченко Ольга Павловна - зам. председателя, д.м.н., профессор

Лурье Юлия Эдуардовна - ученый секретарь

Абрамов Владимир Юрьевич к.м.н.

Абрамова Наталья Николаевна к.м.н.

Агапов Игорь Иванович д.б.н., профессор

Габриэлян Нина Индзаровна д.м.н.

Заико Валерий Михайлович к.физ-мат.н.

Захаревич Вячеслав Мефодьевич д.м.н.

Иванов Алексей Сергеевич д.м.н., профессор

Ильинский Игорь Михайлович д.м.н., профессор

Иткин Георгий Пинкусович д.б.н., профессор

Казаков Эдуард Николаевич д.м.н., профессор

Куприянова Анна Геннадиевна к.м.н., с.н.с.

Матвеев Юрий Георгиевич к.м.н.

Миронков Борис Леонтьевич д.м.н., профессор

Магилевец Вячеслав Михайлович д.м.н.

Мойсюк Ян Геннадьевич д.м.н., профессор

Морозов Борис Николаевич к.м.н.

Олефиренко Галина Александровна д.м.н.

Онищенко Нина Андреевна д.м.н., профессор

Остроумов Евгений Николаевич д.м.н., профессор

Орлова Ольга Владимировна д.м.н.

Попцов Виталий Николаевич д.м.н.

Саитгареев Ринат Шакирьянович д.м.н., профессор

Севастьянов Виктор Иванович д.б.н., профессор

Семеновский Михаил Львович д.м.н., профессор

Скалецкий Николай Николаевич д.м.н., профессор

Строков Александр Григорьевич к.м.н., доцент

Сускова Виктория Сергеевна д.м.н., профессор

Толпекин Владимир Евгеньевич д.м.н., профессор

Томилина Наталья Аркадьевна д.м.н., профессор

Хомяков Сергей Михайлович к.м.н.

Цирульникова Ольга Мартеновна д.м.н.

Честухин Василий Васильевич д.м.н., профессор

Шагидулин Мурат Юнусович к.м.н.

Шаршаткин Алексей Вячеславович д.м.н.

Шмерко Наталья Петровна к.м.н.